Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTF1AQ7RTS3 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms