Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IMPG1Q17R60 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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