Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC8.82□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC8.82□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC8.82□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC8.82□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC8.82□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC8.82□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC8.82□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC8.78□□□□□ -1
GAPVD1Q14C86 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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