Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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