Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GPS1Q13098 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms