Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms