Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRZ1P23471 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRZ1P23471 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRZ1P23471 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRZ1P23471 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRZ1P23471 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRZ1P23471 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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PTPRZ1P23471 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
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PTPRZ1P23471 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
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PTPRZ1P23471 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
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PTPRZ1P23471 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
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PTPRZ1P23471 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
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PTPRZ1P23471 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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PTPRZ1P23471 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTPRZ1P23471 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRZ1P23471 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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