Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SCN11AQ9UI33 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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