Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYW8

RBAK, RB-associated KRAB zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAKQ9NYW8 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBAKQ9NYW8 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms