Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD42Q8N9B4 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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