Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 CDKN2AIPNLP1-201ENST00000460287 302 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC009021.1-201ENST00000566098 375 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC012100.3-201ENST00000624738 575 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NREPQ16612 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 ZNF337-AS1-206ENST00000455791 650 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NREPQ16612 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms