Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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VPS72Q15906 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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VPS72Q15906 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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VPS72Q15906 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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VPS72Q15906 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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VPS72Q15906 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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VPS72Q15906 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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VPS72Q15906 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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