Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RAD50-201ENST00000378823 8306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TACC2-228ENST00000515273 9245 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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