Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms