Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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