Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NME3Q13232 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NME3Q13232 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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NME3Q13232 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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NME3Q13232 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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NME3Q13232 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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