Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MED28P8-201ENST00000454831 521 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 GUSBP3-201ENST00000509348 423 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CCL26-201ENST00000005180 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AP003119.1-201ENST00000533437 538 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 LINC01198-208ENST00000599175 560 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 DNAJC5B-201ENST00000276570 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 UGT2B28-201ENST00000335568 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 HEPACAM2-203ENST00000440868 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 GANC-206ENST00000566442 2512 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LPL-201ENST00000311322 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ADD2-204ENST00000407644 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 OR8G1-202ENST00000641972 5055 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 KIF23-202ENST00000352331 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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