Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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