Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
USP35Q9P2H5 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.6 ms