Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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