Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC38Q502W7 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms