Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms