Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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