Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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