Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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CUL1Q13616 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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CUL1Q13616 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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CUL1Q13616 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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CUL1Q13616 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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CUL1Q13616 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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