Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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ERVFRD-1P60508 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVFRD-1P60508 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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