Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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CNTN3Q9P232 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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CNTN3Q9P232 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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CNTN3Q9P232 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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CNTN3Q9P232 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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