Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AF127936.2-201ENST00000455253 1724 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL740P-201ENST00000467060 344 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPD2P1-201ENST00000489253 354 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 CSF2RA-217ENST00000494969 489 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 DKK2-204ENST00000513208 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AP000757.2-201ENST00000531850 557 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 MUCL1-202ENST00000546809 439 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC026111.1-201ENST00000551090 1195 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC073657.1-202ENST00000562063 334 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC092142.1-202ENST00000567021 829 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AP001442.1-201ENST00000617755 659 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF334-206ENST00000625284 2495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL049844.3-201ENST00000454207 1496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC020549.1-201ENST00000536916 1440 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL133279.3-201ENST00000563140 2352 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AKR1B15-201ENST00000423958 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC012594.1-235ENST00000424391 727 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 OR3B1P-201ENST00000437536 893 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00578-201ENST00000439009 542 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 ELOBP1-201ENST00000447693 357 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL122013.1-201ENST00000473054 801 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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