Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC009495.3-201ENST00000425688 779 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 NPY6R-201ENST00000503807 1112 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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