Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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RTL8BQ17RB0 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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RTL8BQ17RB0 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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