Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
NCOA4Q13772 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC133552.3-201ENST00000572236 1869 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
NCOA4Q13772 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms