Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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TOP3AQ13472 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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TOP3AQ13472 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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