Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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TRAF1Q13077 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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