Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms