Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXQ1Q9C009 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXQ1Q9C009 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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FOXQ1Q9C009 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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FOXQ1Q9C009 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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