Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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