Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PTPRD-AS1-201ENST00000430766 1959 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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