Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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