Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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