Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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FOXF1Q12946 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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