Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NMBRP28336 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NMBRP28336 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NMBRP28336 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NMBRP28336 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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