Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SPI1P17947 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SPI1P17947 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SPI1P17947 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SPI1P17947 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SPI1P17947 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SPI1P17947 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SPI1P17947 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SPI1P17947 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SPI1P17947 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SPI1P17947 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SPI1P17947 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SPI1P17947 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms