Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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USP18Q9UMW8 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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USP18Q9UMW8 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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USP18Q9UMW8 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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USP18Q9UMW8 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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USP18Q9UMW8 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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USP18Q9UMW8 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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USP18Q9UMW8 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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USP18Q9UMW8 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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USP18Q9UMW8 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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