Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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