Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LINC00410-201ENST00000419272 2018 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 NHLRC3-202ENST00000379600 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ARID1A-209ENST00000615191 3804 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 CLDN8-201ENST00000399899 2068 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 EIF4BP4-201ENST00000441847 1780 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 NUTM1-203ENST00000537011 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ZNF726-206ENST00000594466 2473 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 MSS51-201ENST00000299432 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LINC02239-201ENST00000504339 2290 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 EEF1AKMT1-202ENST00000382758 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 OLA1P1-201ENST00000396387 1189 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC116353.1-201ENST00000489727 316 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC113143.2-201ENST00000603849 394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 FAM111A-211ENST00000533703 4202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC074043.1-201ENST00000483126 1776 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SPOCK3Q9BQ16 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms