Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms