Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CBFA2T2-206ENST00000397800 7449 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 CYB5R4-202ENST00000369681 9252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAMA3Q16787 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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