Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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