Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APOBRQ0VD83 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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