Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms